mirna序列查询网站
① 从哪个数据库可查询到miRNA序列信息
给NCBI的序列,都会付给一个编号,而
且这个编号对应的序列不可更改.这个专编号对应这个唯一的一属条序列,类似与我们用的身份证号.因此,利用GI在NCBI中查询时,你只要把数据库(蛋白质/
核苷酸)选对,只要输入这个号码就可以把相应的序列调出来.
值得一提的是登录号(Accession Number).每一个递交的序列,除了获得一个GI号,还会被赋予一个登录号.递交序列的作者利用登录号对序列进行修改和完善.每一次修改的序列会获得一个新的GI号,登录号不变,但会追加一个流水的版本号.
因此,GI号和带版本号的登录号都唯一定位到唯一条序列.
② 初级miRNA和成熟miRNA序列怎么获取
去miRbase,上面有成熟专序属列,www.mirbase.org
③ 如何根据miRNA的序列预测其靶基因,有推荐的软件或网址吗
有了佳学基因,要啥软件
④ 查miRNA的靶基因需要miRNA的序列吗
要知道miRNA的靶基因,肯定要知道你要查哪个miRNA的靶基因,知道是哪个回miRNA,去miRBase上就能知道序列信息了,很答容易获取。
生物信息学预测的话,分植物、动物两种情况,植物是miRNA与靶基因完全匹配,处于mRNA翻译区,动物是2~9位种子序列部分匹配,处于mRNA的3‘UTR区域。
⑤ 如何查找mirna的启动子序列
可以利用UCSC
⑥ 有谁知道一些常见的miRNA的序列及其结合位点在哪查吗
www.mirbase.org
你要复做制miRNA么 有空交流~
⑦ 求大神指导Lnc RNA和miRNA用什么软件或者网站取交集
个人觉得lncrna更有研究前景,mirna序列段作用单一(通过序列互补靶向靶基因专降解或者抑制靶基因)各种属mirna数据库以及针对mirna靶基因预测软件以及数据库甚至高通量实验都已经非常完善。但是lncrna是刚处于研究的起始阶段,其功能机制都不太明确,现有研究只能说明lncrna具有多种功能,因此如果你做lncrna可做的东西非常多,加上lncrna功能复杂因此更具有研究前景。
⑧ 如何利用NCBI查找miRNA前体所在的基因DNA序列
在NCBI主页输抄入要查找的袭miRNA的名称,all database中选择GENE;在搜索结果中选择目的miRNA,在NCBI reference sequences(RefSeq)栏中点击目的miRNA的ID号即转到序列,还可以通过链接到UCSC、miRBase查找
⑨ 在NCBI中如何查找microRNA的序列
直接输miR的名字啊 不过一般都是去mirbase上查找的
⑩ 如何获得miRBase中所有的成熟miRNA的序列信息
嘿嘿,这个很简单,我来告诉你:你首先登入mirbase数据库,进入到download页面,其专实就是这个网址属:http://www.mirbase.org/ftp.shtml 然后下载里面的mature.fa 就OK,这里还有其他的很多mirbase数据可以下哟。。。